В 2009-2010 годах Отделом по расследованию особо важных дел СУ СКП РФ по Новосибирской области в отношении Руднева были возбуждены уголовные дела по признакам преступлений, предусмотренных ч.1 ст.239 УК РФ (организация объединения, посягающего на личность и права граждан), ч.1 ст.131 (Изнасилование) и ч.1 ст.132 (Сексуальные действия насильственного характера) УК РФ. В рамках расследования этих дел 30 сентября сотрудниками милиции, следственного комитета и УФСБ по НСО были проведены обыски в домах, принадлежащих общине Руднева в Новосибирске и в одном из садоводческих обществ Новосибирского района.
В ходе обысков были обнаружены и изъяты печатные, аудио- и видеоматериалы общины, документы, свидетельствующие о характере ее деятельности, различные ритуальные принадлежности. По адресам проведения обысков также обнаружены 38 жителей различных регионов России и Украины, четверо девушек – находились в розыске. Также в ходе обыска у Константина Руднева в присутствии понятых был изъят пакетик с веществом белого цвета, который он сам достал из кармана своей рубашки. Согласно заключению экспертизы, порошок является героином, общий вес составляет около 4 граммов. В этот же день Констанин Руднев был задержан, суд избрал ему меру пресечения в виде содержания под стражей, после чего «гуру» этапировали в изолятор временного содержания.
Сейчас основателю «Ашрам Шамбалы» предъявлено обвинение по трем статьям уголовного кодекса – 131, 132, 239. Решается вопрос о возбуждении уголовного дела еще по одной статье – 228 (незаконное хранение наркотиков).
Сам Руднев, называющий себя Шри Джнан Аватар Муни, представляет себя пришельцем с Сириуса, посланным на землю просветлять людей и вести их к истине. Свое учение «мессия» оформил в книге «Путь дурака», которая разошлась по стране многотысячными тиражами и также принесла немалый доход. Продавали и различные «магические» предметы – амулеты и талисманы, якобы приносящие счастье и удачу. По свидетельству одной из участниц секты, магические карты таро стоили 2500 руб. Недешево обходились и различные ритуальные услуги для вновь прибывших: «диагностика» – 500 руб., «чистка энергетических каналов» посредством массажа –1500 руб. Обряд посвящения – 4000 руб. Один день семинара стоил 700 руб.
В поле зрения правоохранительных органов секта попала уже давно, однако привлечь Руднева к уголовной ответственности оказалось очень сложно: адепты «Ашрама» боготворили учителя, и ни один не желал давать против него показания. Оперативникам и следователям пришлось проделать огромный объем работы, чтобы буквально по крупицам собрать доказательную базу, которая и легла в основу обвинения.

