«Мы создали компьютерную программу для анализа генных сетей на основе эволюционных характеристик генов. И когда просмотрели Cytoscape-приложения, предназначенные для эволюционного анализа генных сетей, то с удивлением обнаружили, что наша работа оказалась первой», – цитирует аспиранта сектора компьютерного анализа и моделирования биологических систем ИЦиГ Захар Мустафин пресс-служба ФИЦ ИЦиГ СО РАН.
.
Таким образом, ученые сравнивают геномы различных организмов, отслеживают родственные гены (схожие по строению, но с возможными различиями по функциям) и сопоставляют их роль в генных сетях.
Сопоставление родственных генов позволяет отследить момент в эволюционной истории живых организмов, когда эти гены возникли, т.е. определить возраст гена.
Новая система уже позволила оценить «эволюционный возраст» более семидесяти болезней. В частности оказалось, что в развитии алкоголизма и никотиновой зависимости участвуют гены, которые появились около 410 млн лет назад (время возникновения насекомых), а в патогенезе астмы и ряда других автоиммунных заболеваний задействованы гены, большая часть из которых появились либо около 160 млн. лет назад, одновременно с возникновением плацентарных млекопитающих, либо ещё позже, около 55 млн. лет назад, с возникновением приматов.
В другом исследовании разработанная программа используется для создания более полной картины генетических механизмов, «запускающих» болезнь Паркинсона.
Как уточняет пресс-служба института, в перспективе работа новосибирских ученых «может привести к созданию самостоятельной многослойной платформы, которая будет приспособлена для работы именно с генными сетями».
Обсуждение темы на Форуме Академгородка
Асadem.info